内蒙古农业大学兽医学学科创建于1952年，1963年开始招收硕士研究生，1981年获硕士学位授予权，1998年获博士学位授子权，2003年获一级学科博士学位授予权，2008年被确定为自治区重点学科，2009年设博士后科研流动站。在张荣臻等前辈带领下，经几代人努力，学科现已发展成3个二级学科11个研究方向，并具有鲜明区域特色和优势。有农业农村部动物疾病临床诊疗技术重点实验室、内蒙古自治区草食家畜兽医基础与疫病防控重点实验室、动物胚胎与发育工程自治区高等学校重点实验室等省部级科研平台3个，马违禁药物检测实验室1个。2020年邀请中国工程院张涌院士成立了内蒙古农业大学家畜种质资源与胚胎工程技术院士专家工作站。